1995年3月～1995年12月，在东北大学资源与土木工程学院任教，1996年1月调入广西大学任教。

1997年5月至2008年10月任广西大学资源与环境学院，2008年11月至2010年9月任资源与冶金学院院长。

2000年12月晋升教授职称，2002年～2003年，由国家留学基金委公派到加拿大多伦多大学做访问学者。

2006年6月被批准为化学工艺学科博士生导师。先后获霍英东教育基金会第七届高等院校青年教师奖（教育类）三等奖，广西大学优秀教师，广西大学优秀党员，广西大学教学质量优秀奖，广西大学第四届、第五届教学成果一等奖，2005年广西高等教育自治区级教学成果奖三等奖，2009年广西高等教育自治区级教学成果奖二等奖，多次被学生评为“我心目中的好教师”。2005年入选“广西新世纪十百千人才工程”第二层次人选和“广西高校百名中青年学科带头人”资助计划，2006-2010年教育部矿物资源工程学科教学指导委员会委员，2009年入选“教育部新世纪优秀人才支持计划”。主持国家自然科学基金项目2项，参加国家自然科学基金项目。^[3] 

2014年7月---至今 任广西大学副校长。

2015年7月28日，广西壮族自治区人民政府关于马少健同志试用期满正式任用的通知中指出：马少健同志（广西大学副校长）试用期满正式任用，任职时间从2014年7月算起。

研究方向

主要研究方向有：粉体工程，矿物材料，矿山环境保护，氰化浸金。

科研成果

⑴企业开发项目：球磨机新型磁性衬板的研究，1992-1994，项目主要参加人员

⑵广西大学科研基金项目：选矿厂锡尾矿综合回收和利用研究，1996-1997，项目主持

⑶企业项目：玉林北市萤石选矿厂选矿流程实验研究和选矿厂设计，1996-1997，项目主持

⑷广西区教育厅科技攻关项目：磨矿过程优化研究，1996-1999，项目主持

⑸广西科技攻关项目：平果铝业公司铝土矿石与粘土干法预分选研究，1997-2000，项目主持

⑹平果铝业公司科技攻关项目：提高平果铝土矿难洗矿石洗矿效率研究，1998，项目主持

学术论文

1、马少健. 用相似理论的方法研究螺旋分级机的生产过程. 第二届全国粉体工程学术会议论文集,浙江杭州,1992.3

2 、马少健,陈丙辰. 颚式破碎机给料与产品粒度关系的研究. 中国科协首届青年学术年会卫星会议及辽宁省首届青年学术年会论文集(东北工学院出版社),辽宁沈阳,1992.12

3 、马少健,陈丙辰. 磁性衬板的现状与发展. 第三届中国青年选矿学术研讨会论文集,辽宁沈阳,1993.10